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软件学院在软件人才培养方面的取得了显著成效，连续两届毕业生就业率均为100%， IBM、Microsoft、Intel、Motorola等著名IT企业中均有我院毕业生的身影；软件工程本科专业2005年被中国大学评价课题组评为139所大学开设该专业的第一名；学院还获得了2005年国家教学成果二等奖和2004年江苏省教学成果一等奖；学生获得了Sun举行的全国大学生2005 Java Cup信息技术大奖赛的第一名，IBM举行的全国大学生2004 Linux随需应变大赛第二名，以及在美国西雅图举行的2005 Microsoft全球嵌入式比赛的第五名.
南京大学软件学院面向全国招收本科生、第二学士学位、硕士研究生，是国家信息产业快速发展的多层次实用性软件人才培养的重要基地。学院根据计算机软件企业的需求，按照工程化、国际化的培养方向，探索新的软件人才培养模式，加大软件人才培养力度。学院的毕业生将是具有国际竞争能力的复合型高级软件技术人才和管理人才，具有扎实的计算机软件基础知识、丰富的计算机软件开发经验、以及较强的软件项目管理能力。
学院在强调基础性和先进性的同时，制订了一套有别于传统计算机学科型人才培养的课程体系，突出工程化、复合型和实用性。一方面，学院结合软件发展潮流，调整和优化软件基础理论知识的教学内容，为学生的创新能力打下扎实的基础。另一方面，学院在课程设置上加大实践和工程方面的课程，重视案例教学和实用技术教学，突出实践能力和工程能力的培养，加强CMM、ISO9000等工程管理以及系统分析和系统设计等方面的教学内容，使学生熟悉现代软件生产的流程；同时，学院注重培养学生在管理、组织协调、知识产权等方面的综合素质，努力培养知识与技能相结合、技术与管理相结合、能力与素质相结合的高级软件人才。
学院充分利用国际国内教育资源，借鉴和引进国外先进的教学与管理经验，在管理体制、教学模式、课程体系与教学内容、教学方法、教材等方面与国际接轨，强化对国际技术标准的认知和实用英语能力的培养。学院目前已初步组建了一支包括博导、教授、博士组成的高水平教师队伍，拥有设备先进的计算机和网络实验室，聘请国内外知名教授和软件专家用英语授课，为学生的学习提供了优质的师资和优越的教学实验条件。同时，学院与国家级软件园、著名软件企业合作建立条件优越的软件教学实践基地，使学生能够参与具体的软件开发，在实践中提升学生的实际工作能力。
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