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南京大学工程管理学院控制与系统工程系创建于2004年，目前拥有“控制科学与工程”一级学科硕士点、“控制工程”工程硕士专业学位点和自动化本科专业，同时招收和培养“系统工程”学科方向博士研究生。现有在校本科生130余人，硕士研究生近40人，博士研究生10余人。已建体现自动化专业特色的专业通识“自动化认知”、专业基础“微机原理与接口技术”、“自动控制原理”、“电机与电力拖动”，专业课程“工业过程控制”、“运动控制系统”，专业创新“机器人基础及创新”、“计算机控制技术”（与Rockwell共建）等实验室共14个，和面向研究生培养的“先进控制技术”和“智能传感与网络技术”等实验室4个，同时设有面向学术和科研的“认知技术与应用中心”。
控制与系统工程系现有教授2人、副教授7人、讲师2人，其他实验教学人员多人，其中90％的教师获得了国内外知名大学的博士学位，已形成一支结构合理、团结奋进、乐于奉献、富于开拓创新精神的高水平教学和科研队伍。近年来，全系已承担国家自然科学基金（含重大研究计划培养项目）7项，省部级基金6项，国防项目（含国家安全973专项（子项）、国防预研基金重点项目等）8项，企业等各类科技项目10余项，科研经费达一千多万元。研究领域主要包括：过程工业企业管理-控制一体化、网络控制系统、量子控制与智能机器人、指挥自动化系统理论与技术、基于增强现实的复杂系统建模与仿真等，并在MES、实时数据管理与挖掘、ERP、智能信息处理与智能系统、认知技术及应用、自动化检测与仪表等方向已形成若干有自己特色且处于国内领先地位或具有国际水平的成果；发表学术论文数百篇，其中被SCI、EI、ISTP 收录近百篇。
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